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アギオス・ファーマシューティカルズ（Agios Pharmaceuticals, Inc.）は2007年に創業し、マサチューセッツ州ケンブリッジに本社を置くバイオ医薬品企業です。


アギオス・ファーマシューティカルズは、米国でがん細胞代謝と先天性代謝異常に特化した治療薬を開発・商業化しています。
主な製品はイソクエン酸脱水素酵素（IDH）2変異を有する進行血液がんに有効である変異型IDH2阻害剤AG-221、またイソクエン酸デヒドロゲナーゼ（IDH）1遺伝子に変異を持つ急性骨髄性白血病の治療薬である経口変形型IDH1阻害剤AG-120です。
他にもピルビン酸キナーゼ（PK）欠損症治療薬である経口PK-R活性化薬のAG-348などがあります。
アギオス・ファーマシューティカルズはがん免疫治療薬の研究・開発・商業化においてセルジーンと提携を結んでいます。